基于生物信息学构建宫颈癌预后相关ceRNA网络

摘要

目的 分析宫颈癌中环状RNA (circRNA)-长链非编码RNA (lncRNA)-微RNA (miRNA)-mRNA网络并构建预后模型。方法 基于癌症基因组图谱(TCGA)和基因表达综合(GEO)数据库的数据，通过生物信息学分析差异基因及关键基因。基于TCGA数据库采用单变量、LASSO和多变量Cox回归分析建立预后m RNA模型，并使用GEO数据库进行验证。利用R包及Cystoscape软件构建Nomogram模型及宫颈癌circRNA-lncRNA-miRNA-mRNA的ce RNA网络。结果 通过单变量、LASSO和多变量Cox回归分析，构建了包含5个mRNA的预后模型，该模型的1、2、3年受试者操作特征曲线下面积分别为0.71、0.71、0.70。同时，在GSE44001中验证预测结果，该预后模型的Nomogram模型C-index为0.707。本研究共构建了包含39个circRNA、27个lncRNA、12个miRNA和5个mRNA的ceRNA网络。结论 本研究揭示的网络有助于探讨宫颈癌ce RNA的机制，构建预后模型及Nomogram模型可以预测患者预后。

关键词

竞争性内源RNA / 环状RNA / 长链非编码RNA / 宫颈癌