基于生物信息学探讨MEF2C在铁死亡相关哮喘中的分子机制

摘要

目的 基于生物信息学方法筛选铁死亡相关哮喘的关键基因，并探讨其在哮喘发生中的分子机制。方法 通过GEO数据库获取哮喘相关数据集，并在铁死亡数据库（FerrDB）中下载铁死亡相关基因，两者取交集得到铁死亡相关哮喘差异表达基因。通过LASSO回归和SVM-RFE算法进一步筛选核心基因。对上述筛选所得基因进行分子生物学验证，并通过哮喘小鼠中的miRNA微阵列数据联合miRWalk与TargetScan预测上游miRNA。结果 首先从GSE43696数据集中筛选出在中、重度哮喘中表型一致的差异表达基因212个，其中包含5种铁死亡相关基因，分别为HCAR1、NOS2、MEF2C、IL6和NOX1。SVM-RFE算法显示，MEF2C对模型的影响最大，实验验证后发现其mRNA与蛋白产物的表达在哮喘小鼠中均下调，且主要在气道上皮细胞核内表达。靶向MEF2C的miRNA预测分析结果发现在哮喘小鼠中上调miR-2861表达可能靶向MEF2C，且miR-2861的表达在IL-17A敲除后显著下调。结论 MEF2C是铁死亡相关哮喘的关键调控因子，其表达下调可能与IL-17A介导的miR-2861表达上调有关。

关键词

哮喘 / 铁死亡 / 生物信息学 / MEF2C / 白细胞介素-17A