纳尔逊海湾病毒感染小鼠巨噬细胞RAW264.7的转录物组分析

摘要

目的 通过分析纳尔逊海湾病毒（NBV）感染小鼠巨噬细胞RAW264.7转录物组测序结果，筛选差异表达基因，探讨固有免疫应答在呼肠孤病毒感染中的作用机制。方法 用感染复数为30的NBV-Miyazaki病毒株感染小鼠巨噬细胞RAW264.7，运用高通量转录物组测序技术，以q<0.05且|log₂FC|≥1为条件，筛选感染组和对照组的差异表达基因，利用基因本体论（GO）和京都基因和基因组数据库（KEGG）对差异表达基因进行富集分析。结果 与对照组相比，感染组差异表达的基因共442个，其中显著上调的基因381个，显著下调的基因61个。差异表达基因在GO富集中主要与固有免疫反应、对病毒的防御反应、细胞因子的产生以及细胞对细胞因子刺激的反应等功能相关，在KEGG中主要富集到Toll样受体信号通路、维甲酸诱导基因Ⅰ样受体信号通路、PI3K/Akt等信号通路。结论 RAW264.7细胞被NBV-Miyazaki病毒感染后，可以通过激活模式识别受体，促进细胞因子、趋化因子和其他免疫相关因子释放，增强抗体依赖细胞介导的细胞毒作用，以发挥免疫效应，为探究固有免疫在NBV-Miyazaki病毒感染过程中的作用机制提供了理论依据。

关键词

纳尔逊海湾病毒 / 巨噬细胞 / 转录物组