东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库

摘要

DNA宏条形码技术已成为环境DNA分析的常用手段，选择合适的引物并建立本地微条形码数据库，对于环境DNA结果的进一步探究十分重要.本文通过数字模拟PCR技术，对食草动物环境DNA研究中常用的3个微条形码进行比较，发现psbCL具有最高或略低于最高的覆盖度和分辨率，在环境DNA分析中推荐优先使用.利用psbCL建立了东北虎豹国家公园本地微条形码库，同时利用psbCL扩增梅花鹿粪便中的进食物种，以比较本地微条形码库和公共数据库在物种鉴别能力方面的差异.结果表明，本地数据库在属和种水平均提高了鉴别能力.因此，本研究推荐环境DNA分析中建立本地微条形码库，以提高研究的精度，本研究所建立的东北虎豹国家公园植物DNA微条形码数据库也将为未来高精度的环境DNA分析提供基础.

关键词

植物DNA微条形码 / 环境DNA / DNA宏条形码 / 条形码数据库 / psbCL