2021—2022年我国部分地区猪轮状病毒分子流行病学调查

摘要

为了解我国部分地区猪场猪轮状病毒(porcine rotavirus, PoRV)的流行情况及分子特征，对2021—2022年我国部分省份的86个规模化猪场的6 472份腹泻样品进行检测，用RT-PCR方法调查PoRV的流行率，并对PoRV阳性样本进行VP7和VP4基因扩增、测序，使用MegAlign软件进行同源性分析，利用MEGA11.0构建系统进化树。结果显示，PoRV的样品阳性率为27.89%(1 805/6 472),猪场阳性率为65.12%(56/86);从98份阳性PoRV样本中扩增出76个VP7片段，G9为优势基因型(42.11%),基因型G5、G26、G3、G4、G1、G2和G11各占26.32%、9.21%、6.58%、6.58%、3.95%、2.63%和2.63%。扩增出的35个VP4基因片段，以P[13]型为主，占57.14%;其次为P[7]、P[23]、P[3]和P[6]型，分别占20%、14.29%、5.71%和2.86%。35个毒株成功鉴定出G/P基因型，G9P[13](28.57%)为优势组合基因型，其他基因型为G5P[13](11.43%)、G4P[13](8.57%)、G9P[23](8.57%)、 G26P[13](5.71%)、G1P[7](5.71%)、G26P[3](5.71%)、G5P[7](5.71%)、G3P[7](2.86%)、G11P[23](2.86%)、G5P[23](2.86%)、G11P[7](2.86%)、G3P[13](2.86%)、G5P[6](2.86%)和G4P[7](2.86%),其中G11P[7]为国内首次鉴定到的基因型。综上，目前PoRV的流行率高且基因型复杂，优势组合基因型为G9P[13]。该结果丰富了PoRV的分子流行病学资料，对我国猪PoRV感染的防控具有重要意义，也为新型疫苗研发提供了参考依据。

关键词

猪轮状病毒 / VP4基因 / VP7基因 / 分子流行病学