新型鹅细小病毒信阳株的全基因组扩增及遗传进化分析

摘要

为了解信阳地区新型鹅细小病毒(NGPV)的遗传变异特性，对疑似NGPV感染麻鸭病例进行病原检测，采集肝脏和脾脏无菌处理后接种SPF鸭胚，成功分离到1株NGPV,命名为HNXY21株，并对其进行全基因组序列分析和VP1基因重组鉴定。序列比对和系统发育树表明，分离株HNXY21和其他9株NGPV同处于鹅细小病毒(GPV)组内的一个独立分支上，与山东分离株SD0316(GenBank登录号：MN415969)核苷酸同源性最高；VP1蛋白的氨基酸序列分析显示，与经典GPV和番鸭细小病毒(MDPV)相比，有8个氨基酸位点突变；通过Simplot软件对VP1基因进行重组分析表明，分离株HNXY21 VP1基因存在重组信号，其潜在的主要亲本为山东分离株SD0316和弱毒疫苗株SYG61v。本研究结果丰富了NGPV的分子生物学资料，为进一步研究NGPV的致病机制奠定了基础。

关键词

新型鹅细小病毒 / 遗传变异 / 重组

基金资助

河南省科技攻关项目(222102110188); 信阳市创新应用专项(20200016); 信阳农林学院重要水禽源病原致病与免疫机制研究科技创新团队项目;信阳农林学院家禽疫病防控科技服务团队项目