甲型流感病毒A/WSN/1933(H1N1)感染A549细胞的circRNA表达谱分析与鉴定

摘要

环状RNA(circRNA)已被证明在众多生物过程中起着重要的调控作用，而circRNA在甲型流感病毒(IAV)复制过程中的功能尚不清楚。本研究旨在利用高通量测序分析IAV感染A549细胞后的circRNA表达谱变化来挖掘能够影响病毒复制的circRNAs并对其进行初步功能鉴定。利用测序结果，对全部circRNAs进行特征分析、差异表达筛选；对差异circRNAs进行GO分析、KEGG分析；对候选circRNAs进行qPCR、RT-PCR验证及Sanger测序鉴定，并通过空斑试验确定影响病毒复制的circRNAs。结果：本试验共筛选到11 630条差异表达circRNAs,对其中6条circRNA进行了鉴定，最终确定novel＿circ＿007428具有抗病毒作用。本研究对甲型流感病毒感染A549细胞后的circRNA表达谱进行了分析与鉴定，为进一步研究circRNA在流感病毒感染中发挥的调控作用奠定了基础。

关键词

环状RNA / 甲型流感病毒 / 基因芯片测序 / A549 / 表达谱 / novel＿circ＿007428

基金资助

“十四五”国家重点研发计划(2021YFD1800205)