基于全基因组关联分析研究文昌鸡初生重性状相关的候选基因

摘要

为筛选文昌鸡初生重相关联的候选基因，本研究采集235只文昌鸡初生重表型值，结合全基因组重测序获得的12 085 689个高质量单核苷酸多态性位点(SNP),利用GEMMA软件进行全基因组关联分析(GWAS)。结果显示：与初生重相关的潜在SNP位点共有11个；通过基因功能注释，确定了6个可能影响初生重的候选基因，分别为cAMP响应元件结合蛋白5(CREB5)、锯齿状Notch配体1(JAG1)、蓝带WH2重复蛋白(COBL)、WD重复结构域11(WDR11)、FIG4磷酸肌酸5-磷酸酶(FIG4)和跨膜结构域蛋白(VSTM2A);进一步富集分析发现，ATP和钙离子结合、钙离子信号通路和MAPK信号通路在初生重中发挥重要作用。本研究结果为文昌鸡初生重相关性状提供了重要的候选分析标记，为进一步选育优良品种提供理论支持。

关键词

全基因组关联分析 / 单核苷酸多态性 / 文昌鸡 / 初生重 / 生长性状