中国帕利亚姆血清群中山病毒的分离及全基因组序列分析

摘要

旨在获取中国帕利亚姆血清群中山病毒(Chuzan virus, CHUV)毒株的全基因组序列并分析其遗传特征。应用BHK-21、Vero、MDBK细胞对云南省江城县采集的152份健康黄牛血液样品盲传分离病毒，针对出现细胞病变样品，采用CHUV VP7蛋白基因片段进行RT-PCR扩增和测序，并对阳性样品进行全长扩增及高通量测序，获得的全基因组序列进行遗传进化分析。结果：1份血液样品可致BHK 21、Vero、MDBK细胞病变；病毒基因组为10节段的“3-3-3-1”带型；病毒基因全长18 914 bp,各基因节段长度在728 bp(Seg-10)～3 930 bp(Seg-1)之间，编码6 072个氨基酸残基，编码蛋白在211(NS3蛋白)～1 295(VP1蛋白)个氨基酸残基之间；通过对保守基因Seg-1,Seg-3、Seg-7的核苷酸系统发育分析，显示与中国本土CHUV亲缘关系最近，为98.17%～99.65%,形成一簇；变异基因Seg-2的核苷酸序列同样与中国本土CHUV毒株相似度最近，为98.76%～99.57%。本研究表明中国CHUV毒株的Seg-1、Seg-3和Seg-7形成了独特的地域型，为深入揭示我国CHUV的致病性和病原学特征提供了基础数据。

关键词

中山病毒 / 分离 / 全基因组测序 / 序列分析 / 帕利亚姆血清群病毒