丹系大白猪与亚洲野猪全基因组选择信号分析

摘要

旨在分析丹系大白猪与亚洲野猪基因组选择清除差异。本研究利用全基因组重测序技术获得43头丹系大白猪及6头亚洲野猪遗传变异信息，联合群体分化程度(Fst)及多样性的变化倍数(π值)两种方法检测受选择区域，并对区域内所含基因进行功能富集分析。结果：丹系大白猪相对于亚洲野猪共有134个受选择区域，包含103个基因，基因本体(GO)功能富集条目主要参与酶代谢，京都基因与基因组百科全书(KEGG)功能富集通路则与生长及生殖相关；经过筛选，发现APC2、AQP9、KISS1R、PAPPA2、PTBP1这5个与大白猪繁殖性能相关的候选基因受到强烈的正向选择。本研究结果进一步揭示了丹系大白猪高繁殖力特性的遗传基础，为国外良种的本土化选育及相关经济性状的分子标记位点开发提供参考。

关键词

丹系大白猪 / 亚洲野猪 / 全基因组重测序 / 选择清除 / 候选基因