1株多重耐药鸡源印第安纳沙门菌特性与全基因组测序分析

摘要

鸡源沙门菌不仅会引起鸡的感染发病，还会威胁食品和公共卫生安全。本研究从安徽肥东地区1只疑似沙门菌感染病鸡组织中分离出1株沙门菌，命名为SM24,评价该菌株的生长曲线，测定菌株致病性和半数致死量(LD₅₀),用Kirby-Bauer法对分离株进行耐药性测试；通过全基因组测序构建分离株基因图谱，分析其携带的毒力和耐药基因特征。结果：分离株在LB培养基中生长良好；对SPF雏鸡具有明显的致病性，LD₅₀为8.50×10～5 CFU;SM24为多重耐药菌株，对青霉素类、头孢菌素类、喹诺酮类、四环素类、磺胺类以及新霉素、庆大霉素、阿奇霉素和氨曲南等16种抗生素表现耐药，对大观霉素、阿米卡星、氯霉素、氟苯尼考、亚胺培南和多黏菌素B敏感；全基因组测序分析表明，SM24为印第安纳血清型沙门菌（Salmonella Indiana）,序列型为ST17,基因组大小为4 865 511 bp, GC含量为51.96%,携带一个IncHI2质粒，大小为165 044 bp; SM24菌株基因组中携带280个毒力相关基因和144个耐药基因，其中整合移动元件（IME）位点和质粒上存在12个耐药基因；SM24菌株与国内报道的鸡源印第安纳沙门菌的遗传距离较远。综上，本研究分离鉴定到1株鸡源印第安纳沙门菌株，具有较强的毒力和多重耐药性，同时解析了菌株的全基因组特征，为深入研究印第安纳沙门菌的致病和耐药机制提供参考。

关键词

鸡源印第安纳沙门菌 / 致病性 / 耐药性 / 毒力基因 / 耐药基因 / 全基因组测序

基金资助

安徽省重点研究与开发计划项目(202204c06020039); 国家蛋鸡产业技术体系项目(CARS-40); 安徽省农业科学院平台项目(2024YL016); 安徽省家禽产业技术体系项目(AHCYJSTX-06)