1株犬冠状病毒山西株变异与遗传进化特征

摘要

旨在阐明分离自山西省的1株犬冠状病毒(CCoV)基因变异与遗传进化特征。将疑似CCoV感染犬粪便接种犬肾传代细胞系(MDCK),收毒后扩增CCoV山西株纤突蛋白(S)基因、膜蛋白(M)基因，分别利用DNASTAR、ESPript 3.x和MEGA-X软件分析基因、氨基酸相似性以及遗传进化关系。结果：CCoV山西株S基因与已公布参考序列的相似性为88.6%～98.3%,M基因相似性为83.6%～96.3%;CCoV山西株S蛋白、M蛋白均存在部分氨基酸位点变异，其中S蛋白主要为氨基酸点突变，M蛋白第10～40位点呈现高频氨基酸突变区；邻近法(Neighbor-Joining)构建遗传进化树结果显示，CCoV山西株属于CCoVⅡ型毒株，与越南分离株LC190907处于同一分支。综上，S基因、M基因分析结果一致，均表明该CCoV山西株属于CCoVⅡ型毒株，存在不同程度的核苷酸、氨基酸变异，与越南分离株亲缘关系最近。本研究结果为山西省CCoV相关疾病的防控提供了重要的参考。

关键词

犬冠状病毒 / 纤突蛋白基因 / 膜蛋白基因 / 同源性 / 遗传进化