山东地区猪流行性腹泻病毒分子流行病学调查及流行毒株的分离鉴定

摘要

猪流行性腹泻病毒(PEDV)感染可引起仔猪急性腹泻和脱水，死亡率高。为了明确山东地区PEDV的流行趋势与遗传进化情况，本研究于2022—2023年对山东省的13个地级市进行了流行病学调查。通过对PEDV N基因的RT-PCR检测，结果在228份疑似腹泻样本中，PEDV阳性率达48.68%;同时，在PEDV感染的样本中，发现PEDV与猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)、猪轮状病毒(PoRV)共感染的现象。对PEDV阳性样本进行S1基因的扩增测序，通过MEGA6软件对PEDV阳性样本进行S1基因的遗传进化分析，发现扩增的4株流行毒株属于GⅡc型，1株流行毒株属于GⅡa型。进一步对流行毒株进行分离，通过PEDV N基因的检测和间接免疫荧光染色，证实成功分离到1株PEDV(命名为SDQD20230628)。对分离株进行S基因的遗传进化分析，发现分离株S基因与GⅡc亚型毒株同源性较近。本研究发现PEDV仍是引起山东地区猪场腹泻猪主要病毒，且呈现出GⅡc亚型毒株趋于流行的趋势，研究结果丰富了山东地区PEDV分子流行病学数据，也为PEDV感染的防控提供了理论依据。

关键词

猪流行性腹泻病毒 / 流行病学调查 / 病毒分离鉴定 / S基因 / 遗传进化 / 山东地区

基金资助

山东省重点研发计划项目(2022TZXD0041,2022CXPT010); 山东省现代农业产业技术体系项目(SDAIT-08); 山东省科技型中小企业创新能力提升工程项目(2023TSGC0849); 济南市新高校20条项目(202333065); 山东省农业科学院农业科技创新工程项目(CXGC2023F10); 泰山学者工程项目