捻转血矛线虫伊维菌素抗药性相关miRNA鉴定及其功能分析

摘要

旨在探究捻转血矛线虫伊维菌素(IVM)抗药相关的miRNA及其功能。本研究以IVM敏感虫株与抗药虫株为试验材料，采用Illumina novaseq 6000平台进行测序，构建cDNA文库，质控分析后采用生信软件筛选2个虫株之间的差异miRNA。结果：IVM敏感株和抗药株雌雄虫共鉴定到441个miRNA,其中已知160个，新鉴定到的281个。与敏感株相比，抗药株雄虫中30个miRNA显著上调，21个显著下调；抗药株雌虫中，4个miRNA显著上调，5个显著下调。后续差异miRNA分析预测miR-1、miR-2、miR-133和miR-5912b可能与IVM抗药性有关。基因本体论(GO)分析显示，雌雄虫差异miRNA靶基因主要富集到细胞修饰氨基酸生物合成过程、磷代谢过程、细胞蛋白质代谢过程、嘌呤核苷酸结合等。此外，京都基因和基因组百科全书(KEGG)显示雌雄虫差异基因富集趋势具有一定的相似性，主要富集到mTOR信号通路、促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、环核苷酸(cAMP)信号通路、赖氨酸降解、嘌呤代谢及三羧酸循环(TCA cycle)等。最终选取6个差异miRNA进行实时荧光定量PCR(RT-qPCR)验证，发现结果与测序结果一致。综上，捻转血矛线虫对IVM抗药性的产生与其代谢过程(尤其是氨基酸代谢)有一定的联系，本研究为揭示IVM抗药机制奠定了理论基础。

关键词

捻转血矛线虫 / 伊维菌素 / 抗药性 / miRNA