禽胚源阴沟肠杆菌的耐药性检测及基因组分析

摘要

旨在分析禽胚源阴沟肠杆菌（Enterobacter cloacae）的耐药性和基因组。从海南、安徽、河南等地的600余份死鸡胚中，分离获得63株禽胚源阴沟肠杆菌，进行耐药性表型分析及全基因组测序，使用测序数据进行阴沟肠杆菌的多位点序列分型（MLST）、耐药基因分析。结果:禽源阴沟肠杆菌菌株耐药性严重程度与人源菌株相比较弱，对于β-内酰胺类的氨苄西林耐药率最高（49.21%），多重耐药（超过6种抗生素）的菌株6株（9.52%）;耐药基因检索结果显示，禽源菌株检索到45种耐药基因，发现测序的15株禽源菌株均携带有β-内酰胺类AmpC耐药基因bla_CMH，与本次耐药表型检测结果呈正相关;人源菌株耐药基因携带量多于禽源菌株;测序的15株菌有1株（ECL036）为ST1型，其他菌株为新的ST型，且MLST进化树显示禽源与人源菌株具有密切遗传关系。本研究对于禽源阴沟肠杆菌的耐药表型进行检测，从基因组水平对于阴沟肠杆菌的耐药基因、MLST型进行分析，为有效防控禽类阴沟肠杆菌病提供理论及数据参考。

关键词

阴沟肠杆菌 / 耐药性 / 耐药基因 / 多位点序列分型

基金资助

安徽省教育厅高校自然科学研究重点项目(2022AH052192); 芜湖职业技术学院一流核心线下课程项目(2023xxkc02); 国家卫生健康委员会肠道病原微生物重点实验室(江苏省疾病预防控制中心)开放基金项目(EM202303)