生畜肉源沙门菌前噬菌体及其携带的耐药基因和毒力基因预测

摘要

旨在预测分析生畜肉源沙门菌前噬菌体的携带情况和分布特征，鉴定前噬菌体携带的耐药基因和毒力基因，提示沙门菌中前噬菌体的功能。利用Phaster在线工具预测沙门菌的前噬菌体携带情况，利用Cards数据库和Vfdb数据库进行耐药基因和毒力基因的预测分析，利用丝裂霉素C诱导前噬菌体。结果：101株沙门菌共预测出645条前噬菌体片段，其中完整型前噬菌体392条、不完整型前噬菌体152条、可疑型前噬菌体101条，平均每株菌携带3.9条完整型前噬菌体；前噬菌体基因组占宿主菌基因组的百分比主要集中在2%～4%,大小以20～40 kb为主。5条前噬菌体携带24个耐药基因，可分为9类，预测产生5种耐药机制。192条前噬菌体共编码256个毒力基因，归类为16种毒力因子，完整型前噬菌体平均每条携带3个毒力基因。肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌前噬菌体可被诱导出。综上，前噬菌体在生畜肉源沙门菌中分布广泛且以完整型为主，携带毒力基因多，耐药基因少，可能对沙门菌毒力具有重要影响。

关键词

沙门菌 / 前噬菌体 / 基因组学 / 耐药基因 / 毒力基因