杜撒×大长撒F₁代猪PCK1基因多态性及其与生长性状的关联研究

摘要

旨在探究杜撒×大长撒F₁代猪磷酸烯醇式丙酮酸羧激酶1（PCK1）基因第二外显子的多态性及其对生长性状的影响。以326头杜撒×大长撒F₁代猪为研究对象，对其PCK1基因第二外显子区域进行PCR扩增和一代测序检测单核苷酸多态性（SNP）位点，在此基础上，通过最小二乘模型将检测到的各SNP位点不同基因型及其单倍型组合与5个生长性状进行关联分析。结果:在杜撒×大长撒F₁代猪PCK1基因第二外显子区域检测到5个SNP位点，其中g. 57930894A>G、g. 57930906G>A和g. 57930912G>A位于5'-UTR区域，g. 57931021C>T和g. 57931090C>T为同义突变。5个位点分别以AG、GG、GG、CC、CC基因型和A、G、G、C、C等位基因频率最高;除g. 57930894A>G位点外，其余位点均符合哈迪-温伯格平衡（P<0.05）。关联研究结果显示，g. 57930894A>G和g. 57930906G>A位点GG基因型与同位点的其他基因型相比能显著降低达100 kg体重日龄（P<0.01）; g. 57930906G>A位点GG基因型个体达60 kg体重日龄也显著低于同位点其他基因型（P<0.01），且该基因型个体30～60 kg体重阶段的日增重显著高于AA和GA基因型个体（P<0.05）; g. 57931090C>T位点CT基因型30～100 kg体重阶段的日增重显著高于CC基因型个体（P<0.05）。单倍型组合与生长性状关联结果显示，AGGCC/GGGTC组合单倍型个体达60 kg体重日龄和达100 kg体重的日龄最长，而以GGGCC/GGGTC和GGGCC/GGGCC组合的日龄最短; 30～60 kg和30～100 kg体重阶段的日增重均以AGGCT/GGGCC组合最高。具有GGGCC单倍型个体的各生长性状均处于较优水平。研究结果初步揭示了杜撒×大长撒F₁代猪PCK1基因第二外显子存在与生长性状显著关联的SNP位点，GGGCC单倍型可作为影响生长性状潜在的遗传标记进行后续研究。

关键词

杜撒×大长撒F₁代猪 / PCK1基因 / 单核苷酸多态性 / 生长性状