不同养殖模式对金陵白鸭和樱桃谷鸭肠道及体表细菌群落结构的影响

摘要

旨在探究不同养殖模式对2种主要盐水鸭养殖品种金陵白鸭和樱桃谷鸭肠道以及体表细菌群落结构的影响。采用传统平养模式和发酵床网床养殖模式饲养，于鸭6周龄时采集胴体、盲肠内容物、粪便等生物样本以及土壤、垫料和空气等环境样本，并检测样品中的细菌群落结构组成。结果:不同品种在同一养殖模式下的肠道和体表细菌群落α多样性相似，但不同养殖模式对同一品种的肠道及体表细菌群落α多样性影响显著，β多样性主成分分析也显示发酵床网床养殖样本与平养样本离散成两类;平养模式与网床养殖相比，会增加粪便中不动杆菌属(Acinetobacter)、埃希菌属(Escherichia)、志贺菌属(Shigella)以及苏黎世杆菌属(Turicibacter)细菌，减少肠球菌属(Enterococcus)和链球菌属(Streptococcus)细菌;增加体表气单胞菌属(Aeromonas)和链球菌属(Streptococcus)细菌，减少慢生根瘤菌属(Bradyrhizobium)细菌;群落功能预测显示网床养殖时，金陵白鸭和樱桃谷鸭粪便中都富集更多发酵和化能异养功能的细菌，体表则会减少硝酸盐还原和发酵功能的细菌并富集好氧化能异养细菌，但是两品种鸭盲肠内容物中会富集不同功能的细菌，环境样本中与养殖动物直接接触的垫料表现出与肠道菌群更类似的特性。综上，养殖模式会显著改变盐水鸭养殖品种肠道及体表细菌群落结构，从而进一步影响其功能。

关键词

金陵白鸭 / 樱桃谷鸭 / 传统平养模式 / 发酵床网床养殖 / 肠道微生物组 / 体表微生物组