布鲁氏菌感染下人鼠同源lncRNA的差异性表达分析

摘要

旨在研究布鲁氏菌侵染小鼠巨噬细胞和人胚胎滋养层细胞后，人鼠同源的长链非编码RNA(lncRNA)转录水平表达差异性。参考相关文献筛选出21对人鼠同源lncRNA待检靶基因，以感染复数(MOI)=100的流产型布鲁氏菌S2308侵染小鼠巨噬细胞(RAW264.7)和人胚胎滋养层细胞(HTR-8)，实时荧光定量PCR检测不同时间点21对人鼠同源lncRNA表达量;利用在线网站对人鼠同源lncRNA进行生物信息学分析，构建竞争性内源RNA(ceRNA)网络图，进行生物富集分析。结果:布鲁氏菌侵染RAW264.7细胞时，与对照组相比，21对lncRNA在不同时间段转录水平存在差异，如lncRNA Gm28592在侵染后4、8、12 h转录水平显著上调(P<0.05);布鲁氏菌侵染HTR-8细胞时，与对照组相比，18条lncRNA在侵染后8 h转录水平均存在显著差异(P<0.001)，在其他时间段有6条lncRNA转录水平呈显著差异性(P<0.001); lncRNA Gm29331、Gm28592在上述2种细胞中侵染后4、8、12 h的转录水平增加趋势相同，但上调幅度具有差异，lncRNA Gm37803-201转录水平下降趋势相同且在侵染后4 h转录水平增加幅度具有差异。综上，布鲁氏菌侵染RAW264.7和HTR-8细胞，在同一时间，不同人鼠同源lncRNA转录水平呈差异性表达;同一人鼠同源lncRNA在不同侵染时间，其转录水平亦呈差异性，本研究筛选出3条表达趋势一致且转录水平差异表达的lncRNA并对其进行生物信息学分析，为进一步探究布鲁氏菌致病机制提供了新的思路。

关键词

布鲁氏菌 / 人鼠同源lncRNA / 转录水平 / 差异表达