患病绵羊肺组织关键病原微生物宏基因组解析与谱系特征研究

摘要

旨在解析绵羊感染性呼吸系统疾病的病原微生物，探讨绵羊品种与微生物同源基因组表达的关系，为绵羊抗病育种及高效生产奠定基础。选取同一饲养环境下180日龄的澳杜湖三元杂交羊36只和多浪羊25只，采集其肺组织样品共61份，采用宏基因组学技术分析肺组织微生物群落组成，结合PCR扩增技术鉴定主要病原微生物，同时检测促炎细胞因子表达情况，分析不同品种绵羊微生物同源基因组表达差异。结果:共鉴定出13种绵羊肺组织关键呼吸系统微生物; PCR扩增结果证实，绵羊肺腺瘤病毒是该群体绵羊肺组织的主要病原微生物;同源基因组表达分析表明，澳杜湖三元杂交羊微生物同源基因组能量主要用于RNA加工和修饰，多浪羊微生物同源基因组能量主要用于碳水化合物、次生代谢物的运输与代谢及防御机制;促炎细胞因子检测结果显示，2个品种绵羊在基因表达和能量分配上存在明显差异。相关性分析表明，绵羊品种与肺组织微生物功能表达之间存在高度的相关性。结论:绵羊肺腺瘤病毒是该群体绵羊感染性呼吸系统疾病的主要致病微生物，澳杜湖三元杂交羊与多浪羊的微生物同源基因组表达存在品种特异性，绵羊品种与肺组织微生物功能表达密切相关。

关键词

绵羊 / 肺组织微生物 / 宏基因组 / 呼吸系统疾病

基金资助

国家科技重大专项(2023ZD0405103,2022ZD040130205); 自治区现代产业技术体系项目(xj ARS-09-06); 省部共建草食家畜遗传改良与种质创新国家重点实验室项目