2023—2024年华东地区PRRSV ORF5基因的分子流行病学与遗传演化分析

程静; 陈俭; 肖薇; 吴金龙; 孙春清; 刘兆喜; 李铎; 李玉博; 刘林青; 张振东

畜牧与兽医 ›› 2026, Vol. 58 ›› Issue (10) : 85 -92.

程静, 陈俭, 肖薇, 吴金龙, 孙春清, 刘兆喜, 李铎, 李玉博, 刘林青, 张振东

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摘要

旨在分析华东地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行特征及ORF5基因遗传演化规律。本研究于2023—2024年从华东地区六省一市的规模化猪场收集236份疑似PRRSV感染的临床样品，荧光定量PCR(qPCR)检测样品显示，PRRSV2总体阳性率为19.92%(47/236)，未检出PRRSV1;经反转录PCR(RT-PCR)扩增与基因测序，成功获得32条ORF5全长基因序列。与GenBank常见参考毒株ORF5基因进行核苷酸同源性分析并构建系统发育进化树，结果显示32条ORF5序列分布在谱系1(占比75%)、谱系5(占比9.4%)和谱系8(占比15.6%) 3个谱系中，其与代表性毒株NADC30/NADC34(谱系1)、VR2332(谱系5)和JXA1(谱系8)的核苷酸同源性范围分别为84.4%～95.9%、81.8%～99.3%和81.7%～99.3%。重组分析表明，32条ORF5基因序列中有10条存在不同程度的重组，重组模式以NADC30(谱系1.8)与NADC34(谱系1.5)为主(8/10)。GP5蛋白氨基酸序列变异分析显示，变异主要集中于2个高变区与诱饵表位区。本研究结果丰富了华东地区PRRSV的分子流行病学数据，为该区域猪繁殖与呼吸综合征的综合防控提供了参考。