基于转录组测序探讨柚皮素对脂多糖作用下人牙周膜干细胞的抗炎作用及相关机制

摘要

目的 联合使用转录组测序（RNA-seq）和生信分析，探究柚皮素（Nar）对脂多糖（LPS）刺激下的人牙周膜干细胞（hPDLSCs）的抗炎作用及机制。方法 采用细胞计数试剂盒（CCK-8）、实时荧光定量逆转录聚合酶链反应（qRT-PCR）、酶联免疫吸附试验（ELISA）检测Nar对LPS刺激下hPDLSCs增殖及炎性因子表达情况，筛选出Nar的最佳抗炎浓度。采用RNA-seq，以|log2FC|≥1且P≤0.05为标准筛选出显著差异基因（DEGs）。采用火山图分析、京都基因与基因组百科全书（KEGG）通路富集分析、String数据库及Cytoscape的MCODE模块筛选核心基因。ELISA、qRT-PCR和蛋白印迹实验（Western blot）检测对核因子κB (NF-κB)信号通路的影响。结果 适宜浓度的Nar可减轻LPS刺激下hPDLSCs的炎症因子表达，促进其增殖，20μmol/L Nar抗炎效果最佳。RNA-seq提示炎症相关信号通路显著富集。Nar通过抑制NF-κB信号通路产生抗炎作用，Nar与NF-κB抑制剂BAY 11-7802效果相似。结论 Nar可以通过抑制NF-κB信号通路发挥抗炎作用。Nar可能是辅助治疗牙周炎的一种潜在的药效成分。

关键词

柚皮素 / 人牙周膜干细胞 / 抗炎作用 / 核因子κB / 转录组测序