利用系统作图解析藏川杨邻株互作遗传调控机理

摘要

【目的】植株之间的互作对生态系统的形成具有重要意义，本研究在邻株互作这一最小的种内互作单元水平上，研究植物间相互作用的遗传调控机制。【方法】以不同系号的藏川杨自然群体作为研究材料，两两随机配对扦插于花盆中，调查其生长季的株高动态表型；结合本群体SNP标记数据，基于系统作图进行藏川杨的全基因组基因定位工作，定位显著QTL；利用GO富集分析和构建常微分互作网络，分析候选基因的功能。【结果】（1）共定位到92个显著位点，可注释到31个候选基因。（2）GO富集分析中，生物学过程包括生长素信号通路和脱落酸信号通路等，分子功能包括内肽酶活性和蛋白酶活性等，细胞组分包括呼吸链和细胞色素等。（3）在31个候选基因中，第5、8、10、12、21号基因是直接效应网络的枢纽基因，第5、8、10、13号基因是间接效应网络的枢纽基因，第5、8、13号基因是上位互作网络的枢纽基因，其中5、10、13基因参与植物免疫反应和响应环境胁迫。【结论】对于藏川杨间的种内邻株互作，系统作图可筛选互作相关的遗传位点，构建遗传调控网络并挖掘枢纽基因，可为解析木本植物互作的遗传机制提供新的视角。

关键词

系统作图 / 邻株互作 / 调控网络 / QTL / 藏川杨