水稻柱头外露率主效QTL qTSE4的定位

何晓娟; 万华; 高俊文; 顾伟航; 谢振威; 赵志刚; 万建民

南京农业大学学报 ›› 2023, Vol. 46 ›› Issue (02) : 217 -225.

何晓娟, 万华, 高俊文, 顾伟航, 谢振威, 赵志刚, 万建民

作者信息 +

Author information +

文章历史 +

摘要

[目的]柱头外露率是杂交水稻制种的一个重要指标，本研究旨在检测控制水稻柱头外露率QTL及精细定位相关基因。[方法]以低柱头外露率粳稻品种‘02428’和高柱头外露率亲本ZH464配组的F_2群体进行QTL位点检测，在目标区域内利用分子标记筛选杂合单株，对连续自交获得的F_(2:3)和F_(3:4)群体进行多年稳定QTL位点定位，同时利用BSA-seq技术对F_(3:4)群体进行柱头外露率QTL定位和候选基因序列分析。[结果]相关性分析结果显示单柱头外露率、双柱头外露率和总柱头外露率这3个性状存在极显著的相关性。以总柱头外露率作为表型数据，利用已构建的覆盖全基因组分子连锁遗传图谱进行QTL定位，检测到第2和4染色体上的2个位点：qTSE2和qTSE4,选择贡献率大的qTSE4位点进行后续研究，该位点在F_(2:3)和F_(3:4)群体中被重复检测到。结合BSA-seq测序结果，在qTSE4位点区间内筛选到2个存在差异的基因。[结论]qTSE4位点作为柱头外露相关的主效QTL位点，可进行后续的精细定位，筛选到的2个候选基因有待进一步转基因功能验证。