细胞凋亡、坏死和焦亡信号网络关键节点的识别

摘要

细胞死亡作为一项基本的生命过程，在生物体的发育、自稳态和病理方面有重要作用.寻找细胞死亡信号通路中的关键节点一直是领域的研究焦点，而信号网络的构建及分析可为其提供重要的理论参考.主要关注凋亡、坏死和焦亡这3种研究最多的细胞死亡方式.首先从已发表文献和生物信息数据库中获取初步数据，对数据进行文本处理，利用处理后的数据构建凋亡、坏死和焦亡的信号网络.然后分别计算各网络的度中心性、介数中心性、接近中心性和特征向量中心性指标，并利用k-壳分解和社团发现方法对节点进行不同的划分.最终综合上述方法所得结果，鉴定出各网络中的关键节点.

关键词

细胞死亡 / 信号网络 / 中心性指标 / k-壳分解 / 社团发现