聚球藻XM24中发现疑似为硅酸转运子的基因

摘要

硅是硅藻所必需的营养物质.硅藻可以通过硅酸转运子（Silicon Transporter,SIT）蛋白吸收环境中的溶解硅，在全球海洋的硅循环中起着重要作用.海洋单细胞聚球藻（Synechococcus）也被发现可以进行硅的累积作用.由于聚球藻进化出现的时间远远早于硅藻，推测也可以像硅藻一样通过SIT这样的转运蛋白来吸收海洋中的溶解硅.本研究在有硅和无硅两种条件下探究聚球藻中SIT存在的可能性，最终找到2条疑似为SIT基因序列，并成功预测得到其蛋白质序列及功能，结果显示均与膜转运过程有关.最终利用AutoDock4软件成功预测到蛋白质的活性位点.

关键词

SIT基因 / 聚球藻 / 宏转录组 / 蛋白质预测 / 分子对接模拟 / 海洋生物学