湘江细鳞鲴群体遗传多样性及种群历史动态研究

摘要

本研究共采集湘江永州段（YZ）、衡阳段（HY）、东江湖段（DJH）、茶陵段（CL）和浏阳段（LY）五个群体的细鳞鲴（Xenocypris microlepis）188尾,并利用线粒体DNA的D-Loop区序列,分析湘江细鳞鲴的群体遗传多样性及种群历史动态。在测序获得的188条D-loop序列中共检测出变异位点37个,单倍型24个,单倍型多样性（H_d）、核苷酸多样性（P_i）和群体间遗传距离分别为0.755—0.911、0.00277—0.00556和0.00467—0.00658。24个单倍型中仅Hap1为5个群体的共享单倍型,且单倍型间未形成与地理位置相对应的进化支聚类关系。分子方差分析结果显示, 5个群体的遗传变异主要来源于群体内部（90.48%）,而群体间的遗传差异仅占总变异的9.52%。UPGMA聚类分析显示, HY与LY聚为一支, YZ与CL聚为一支。基于F_st指数的计算表明, HY与DJH和CL存在低等程度的遗传分化, DJH与YZ和CL, LY与其他4个群体均存在中等程度的遗传分化,而YZ与CL和HY均不存在分化。Mantel test分析发现,湘江细鳞鲴群体遗传差异与地理距离间不存在显著相关性。中性检验及核苷酸错配分析表明湘江细鳞鲴历史上未经历大规模种群扩张或收缩,而贝叶斯天际线模型推演结果则揭示了从25万年前至今,除HY细鳞鲴群体扩张外,其余4个群体均呈现收缩态势。研究结果对于评价湘江流域细鳞鲴资源恢复效果及种质资源保护与利用提供参考。

关键词

湘江 / 遗传多样性 / D-loop / 单倍型 / 种群动态 / 细鳞鲴