两种体色草鱼杂交F1代生长、肌肉营养成分及皮肤转录组比较分析

摘要

为探究两种不同体色三组草鱼家系F1代生长性能、肌肉品质以及体色相关基因表达的特征,本研究通过构建金色草鱼(♀)×金色草鱼(♂)[Ctenopharyngodon idella var.gold(♀)×C. idella var.gold(♂)] F1代(GG)、金色草鱼(♀)×普通体色草鱼(♂)[C. idella var.gold(♀)×C. idella(♂)] F1代(GB)及普通体色草鱼(♀)×普通体色草鱼(♂)[C. idella(♀)×C. idella(♂)] F1代(BB)三个家系,借助形态学、营养学测定方法和RNA-seq技术对其生长特性、肌肉品质和皮肤转录组特征进行了系统分析发现:(1)生长性能方面, GG家系在增重率和特定生长率方面显著高于BB和GB家系(P<0.05),呈现GG>BB>GB的趋势;(2)肌肉品质方面, GG家系具有显著较高的水分含量(P<0.05)和显著较低的粗脂肪含量(P<0.05),且二十碳五烯酸(EPA)+二十二碳六烯酸(DHA)含量、氨基酸总量(TAA)、必需氨基酸总量(TEAA)和呈味氨基酸总量(TDAA)均显著高于BB和GB家系(P<0.05);(3)蛋白质质量评价方面, GG家系的氨基酸评分(AAS)、化学评分(CS)和必需氨基酸指数(EAAI)均高于BB家系和GB家系;(4)转录组分析方面, GG和BB间及GB和BB间的差异表达基因(DEGs)显著富集于ATP代谢过程、核苷一磷酸代谢过程及嘌呤核苷一磷酸代谢过程、线粒体、血红素结合、四吡咯结合和氧化还原酶活性等GO功能条目及氧化磷酸化和细胞黏附分子等通路,并筛选获得cdk4、mt-atp6、csf1r、xdh和sox9b等与草鱼体色形成相关的DEGs。结果表明, GG家系在生长性能和肌肉品质均显著优于GB和BB家系,且获得两种体色差异相关基因,为阐明体色变异的遗传分子机制和金色草鱼选育提供了科学依据。

关键词

生长性能 / 营养成分 / 杂交 / 转录组 / 肌肉品质 / 体色 / 草鱼