NO介导下藜麦LAZ1基因家族生信分析及盐碱胁迫下的表达模式

摘要

利用生物信息学方法，从藜麦基因组中鉴定LAZ1基因家族成员，并对其基本理化特性、二级和三级结构、系统进化关系、染色体定位、基因复制、基因结构和启动子区顺式作用元件等进行分析。利用转录组数据结合RT-qPCR分析LAZ1家族基因在混合盐碱胁迫和外源NO处理下不同器官和时间的表达模式。结果显示，在藜麦基因组中共鉴定到11个LAZ1基因，系统发育分析将LAZ1基因家族分为3个亚家族；片段复制是该基因家族进化的主要原因，并在进化过程中经历了强烈的纯化选择；在转录组分析基础上，对其中6个LAZ1基因在盐碱胁迫和NO处理下的RT-qPCR鉴定分析表明，不同的LAZ1基因在不同组织中表达，响应混合盐碱并受到NO的正向调控，其中CqLAZ1-9在盐碱胁迫下根中的相对表达量提高了129.6倍。综上所述，本研究从藜麦基因组中鉴定了11个LAZ1家族成员，不同成员在不同组织中具有不同的表达模式，其中CqLAZ1-9响应盐碱胁迫和外源NO的能力最强。

关键词

藜麦 / LAZ1基因家族 / NO / 生信分析 / 盐碱胁迫