北柴胡根腐病发展过程中根系微生物群落组成变化规律研究

摘要

为探究北柴胡(Bupleurum chinense DC.)感染根腐病后微生物群落变化规律，采用高通量测序技术，系统分析了健康、发病初期和发病末期北柴胡根周土、根际土及根内真菌与细菌群落结构、群落动态变化及主要差异群落的功能。结果表明：根腐病主要影响根内微生物群落结构，随着病害发展，根内真菌多样性指数逐渐降低，Chao1与ACE指数分别下降65.69%与65.75%。其中，镰刀菌属(Fusarium)的相对丰度由健康组的0.47%升至发病末期的9.63%,腐皮镰刀菌(F.solani)为发病末期差异类群中LDA值最高的菌种，推测其可能为北柴胡根腐病的主要致病菌。相比之下，根内细菌多样性随病害发展呈上升趋势，Chao1与ACE指数分别增长90.18%与86.52%。其中根瘤菌属复合群(Allorhizobium-Neorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium)为发病末期特有差异类群，相对丰度增长达106.22%,推测北柴胡可能会通过招募有益细菌增强其抗病性。

关键词

北柴胡 / 根腐病 / 根系微生物组 / 真菌多样性 / 细菌多样性