白麻NAC基因家族全基因组鉴定及其干旱胁迫下表达分析

摘要

基于白麻基因组数据，在白麻全基因组范围内鉴定了53个NAC基因家族成员，并对其染色体分布、系统发育、基因和蛋白结构、蛋白理化性质与功能、顺式作用元件进行预测分析，并结合干旱胁迫下的转录组数据分析NAC基因的表达。结果显示，白麻的ApNAC基因家族分布在10条染色体中，包括7对片段复制形成的共线性基因对和2对串联重复基因对。53个ApNAC家族成员可以分为15个亚家族，每个成员都含有5个以上的保守基序，同一个亚家族成员有着相似的基因结构。白麻NAC蛋白属于亲水性蛋白，亚细胞定位结果显示其以转录因子的形式发挥功能，并富集在DNA特异性结合功能以及木质部、叶片和细胞壁的发育调节功能中。启动子区域的顺式作用元件分析表明，ApNAC基因家族与脱落酸、干旱胁迫以及光响应调控相关。在30%PEG-6000诱导的干旱胁迫下，26个ApNAC成员在不同阶段发生差异表达，其中21个基因整体上调，5个基因下调。

关键词

白麻 / NAC基因家族 / 干旱胁迫 / 基因差异表达