基于TCGA数据分析TRIM45基因在乳腺癌中的表达特征及生物学功能

摘要

目的 基于GDC TCGA Breast Cancer (BRCA)的数据，评估TRIM45(Tripartite Motif Family 45)在乳腺癌中的表达、预后价值及其与临床病理的相关性，揭示TRIM45在乳腺癌中的生物学功能及可能的作用机制。方法 采用R软件对GDC TCGA Breast Cancer (BRCA)数据进行生信分析，研究TRIM45在乳腺癌中的表达及其与临床病理的关系。采用Kaplan-Meier法评估TRIM45对乳腺癌预后的影响。应用KEGG基因集进行GSEA(Gene Set Enrichment Analysis)基因富集分析，采用Spearman相关性分析筛选TRIM45相关作用基因。结果 TRIM45在乳腺癌临床样本中的表达高于癌旁组织(P<0.001);Kaplan-Meier生存分析显示TRIM45高表达患者的总生存期高于TRIM45低表达者(P<0.05);TRIM45在乳腺癌中的表达与T分期、TNM分期、分子分型及病理类型相关联(P<0.05);GSEA富集分析结果显示TRIM45在KEGG＿PATHWAYS＿IN＿CANCER信号通路中发挥重要的生物学作用，Spearman相关性分析筛选出TRIM45与STK36、IKBKB、GLI3具有正相关关系(P<0.001),与HIF1A具有负相关关系(P<0.001)。结论 TRIM45在乳腺癌中的表达与T分期、TNM分期、分子分型及病理类型相关联；TRIM45可能通过调控STK36、IKBKB、GLI3和HIF1A在乳腺癌发生发展中发挥重要作用。

关键词

TRIM45 / 乳腺癌 / 癌症基因组图谱 / 生物信息学分析