广深地区3种常见猫病毒的分离鉴定及遗传进化分析

摘要

【目的】猫杯状病毒(Feline calicivirus,FCV)、猫细小病毒(Feline parvovirus,FPV)和猫疱疹病毒1型(Feline herpesvirus-1,FHV-1)是常见的高传染性、高致病性病原体，本文针对广深地区的这3种病毒开展研究，以期明确本地FCV、FPV和FHV-1的流行情况、遗传变异和演化方向。【方法】本研究于2021年10月至2022年6月收集了广州、深圳地区的动物医院、动物收容所和华南农业大学病猫的眼鼻口拭子、肛拭子样本，通过提取临床样本核酸、one step RT-PCR、常规PCR技术检测FCV、FPV及FHV-1；对阳性样品进行基因扩增及测序，利用DNAStar分析核苷酸序列相似性，使用MEGA 7.0构建系统发育树；使用克兰德尔-里斯猫肾(Crandell-Reese feline kidney,CRFK)细胞接种FCV、FHV-1阳性样品进行病毒分离，连续盲传至出现细胞病变，利用PCR、电子显微镜等技术鉴定分离毒株。【结果】379例具有临床症状的病猫中，FPV、FCV、FHV-1感染率分别为22.16%、19.00%和3.17%；病毒阳性率与猫只性别无关，6月龄及以下患猫中FCV、FPV检出率最高，分别为63.89%、58.33%,FHV-1在12月龄及以上患猫中阳性占比最高，为66.67%。已免疫“妙三多”疫苗的患猫中FCV、FHV-1、FPV均有检出，阳性率分别为75.00%、75.00%、20.24%。成功分离到7株FCV、1株FHV-1和2株FPV。7株FCV分离株全基因组与参考株的核苷酸相似性为75.0%～87.5%,7株FCV分离株形成了两大分支，GZ-1-249和GZ-1-184属于GI分支，而其他5株分离株均属于GII分支。14条FPV VP2基因序列与参考株的核苷酸相似性为97.4%～100.0%,14条序列与“妙三多”疫苗株M38246.1(FPV USA Cu4)等序列共同归属于一大分支。【结论】研究结果丰富了FCV、FPV和FHV-1相关流行病学数据，增强了对本地流行毒株的认识，为未来本土疫苗的研发和优化提供了重要支持。

关键词

猫杯状病毒 / 猫细小病毒 / 猫疱疹病毒1型 / 分离 / 鉴定 / 遗传进化