冬瓜DnaJ基因家族鉴定与表达分析

摘要

【目的】系统鉴定冬瓜Benincasa hispida DnaJ基因家族成员，明确其亚家族分类、基因结构、进化关系及组织表达特异性，为深入解析其在冬瓜中的生物学功能奠定基础。【方法】基于冬瓜全基因组数据鉴定DnaJ基因家族成员，运用生物信息学方法分析其染色体定位、蛋白理化性质、基因结构、系统进化关系、基因复制事件及启动子顺式作用元件，利用RT-qPCR技术检测DnaJ基因在不同组织部位的表达模式。【结果】在冬瓜中共鉴定出65个DnaJ家族成员，根据系统进化树划分为7个亚家族，其中5对基因具有共线性关系，45对与拟南芥DnaJ基因存在同源关系；这些成员在12条染色体上均有分布，其中9号染色体分布数量最多，为9个；启动子区分析显示，该家族成员显著富集多种与光响应、激素(如脱落酸、赤霉素)应答及逆境胁迫(如干旱、低温)相关的顺式作用元件；组织特异性表达分析表明，不同DnaJ基因表达存在明显差异，如Bhi02M001163、Bhi09M000795和Bhi10M001058在雌花中的表达量最高，Bhi11M001536在雄花中的表达量最高，Bhi05M001234和Bhi09M002103在顶芽中的表达量最高。【结论】本研究系统鉴定了冬瓜DnaJ基因家族成员，揭示了其进化特征与表达模式，为解析该家族基因在冬瓜生长发育及逆境响应中的功能和调控机制提供了重要理论依据。

关键词

冬瓜 / DnaJ基因家族 / 生物信息学 / 表达分析 / 胁迫响应