黄精转录组特性分析及相关功能基因研究

摘要

分析黄精转录组数据,挖掘与黄精中多糖、皂苷元、黄酮生物合成途径相关的关键酶基因.利用Illumina HiSeq测序平台对黄精全株进行转录组测序,对测序结果进行注释分析.共获得146 072个有效转录本,超过51.00%的转录本在NR、Swiss-Prot、KOG、GO、KEGG数据库中获得注释.β-呋喃果糖苷酶、己糖激酶等参与了黄精多糖的生物合成;UDP-葡萄糖基转移酶、β-葡萄糖苷酶等参与黄精皂苷元的生物合成途径;查尔酮异构酶、查尔酮合成酶等参与黄精内黄酮的生物合成途径.初步获得黄精中参与黄精多糖、皂苷元、黄酮生物合成的候选关键酶基因,为进一步研究黄精的生理生化代谢奠定了基础.

关键词

黄精 / 转录组 / 多糖 / 皂苷 / 黄酮

基金资助

四川省高校重点实验室开放课题(SCYZ201901)