黄精转录组特性分析及相关功能基因研究

王宇, 谭福燕, 张利萍, 何玉丰, 范建辉, 李旺, 彭柿杰, 邱庆华

四川师范大学学报(自然科学版) ›› 2022, Vol. 45 ›› Issue (01) : 103 -109.

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四川师范大学学报(自然科学版) ›› 2022, Vol. 45 ›› Issue (01) : 103 -109.

黄精转录组特性分析及相关功能基因研究

    王宇, 谭福燕, 张利萍, 何玉丰, 范建辉, 李旺, 彭柿杰, 邱庆华
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摘要

分析黄精转录组数据,挖掘与黄精中多糖、皂苷元、黄酮生物合成途径相关的关键酶基因.利用Illumina HiSeq测序平台对黄精全株进行转录组测序,对测序结果进行注释分析.共获得146 072个有效转录本,超过51.00%的转录本在NR、Swiss-Prot、KOG、GO、KEGG数据库中获得注释.β-呋喃果糖苷酶、己糖激酶等参与了黄精多糖的生物合成;UDP-葡萄糖基转移酶、β-葡萄糖苷酶等参与黄精皂苷元的生物合成途径;查尔酮异构酶、查尔酮合成酶等参与黄精内黄酮的生物合成途径.初步获得黄精中参与黄精多糖、皂苷元、黄酮生物合成的候选关键酶基因,为进一步研究黄精的生理生化代谢奠定了基础.

关键词

黄精 / 转录组 / 多糖 / 皂苷 / 黄酮

Key words

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黄精转录组特性分析及相关功能基因研究[J]. 四川师范大学学报(自然科学版), 2022, 45(01): 103-109 DOI:

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