疏花地榆的叶绿体基因组和系统位置分析

摘要

对疏花地榆（Sanguisorba diandra）叶绿体基因组的研究发现，其基因组为环状结构，全长为154 832 bp,GC含量37.3%；基因组呈典型的四分体结构，包括一个大单拷贝区（large single copy region,LSC）、一个小单拷贝区（small single copy region, SSC）和两个反向重复区（inverted repeats, IRs），长度分别为85 013 bp、18 703 bp和25 558 bp,GC含量分别为35.3%、31.4%和42.8%。疏花地榆叶绿体基因组共编码129个基因，包括84个蛋白质编码基因（protein-coding genes, PCGs）、37个转运核糖核酸（tRNA）基因和8个核糖体核糖核酸（rRNA）基因，其中17个基因在IR区有2个拷贝。系统发育分析结果表明，地榆属为单系类群，疏花地榆与矮地榆（Sanguisorba filiformis）的亲缘关系最近。

关键词

疏花地榆 / 叶绿体基因组 / 地榆属 / 蔷薇科