mRNA三级结构局部碱基对螺旋参量对蛋白质折叠速率的影响

摘要

为研究局部碱基对螺旋参量对蛋白质折叠速率的作用机制，收集了100个具有实验折叠速率的蛋白质，通过计算获得各个蛋白质相对应的mRNA三级结构数据，筛选出其中的局部碱基对螺旋参量，深入研究这些参量与蛋白质折叠速率之间的相关性；将所选蛋白质按照折叠类型和二级结构进行分组，进而分析这些参量对不同类蛋白质折叠速率影响的差异。研究结果表明，蛋白质折叠速率与X-disp、Y-disp、h-Rise、Incl(η)、Tip(θ)和h-Twist六个参量存在不同程度的相关性，说明mRNA三级结构的局部碱基对螺旋参量在调控蛋白质折叠速率方面发挥了重要作用。

关键词

RNA三级结构 / 局部碱基对螺旋参量 / 蛋白质折叠速率 / 相关性