mRNA三级结构回转半径对蛋白质折叠速率的影响

田旭; 李瑞芳; 彭诗雅; 高姗; 邓俊超; 黄娜; 付恒瑞

内蒙古师范大学学报（自然科学版） ›› 2026, Vol. 55 ›› Issue (1) : 10 -17.

田旭, 李瑞芳, 彭诗雅, 高姗, 邓俊超, 黄娜, 付恒瑞

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摘要

回转半径（R_g）作为体现mRNA三级结构空间紧凑性的重要参量，其值越小对应的结构越紧密。构建含105个已知蛋白质折叠速率的蛋白质数据集，用3dRNA和3DNA软件计算了各蛋白质所对应的mRNA三级结构，从计算结果中整理出回转半径值，分析了蛋白质折叠速率与mRNA三级结构回转半径的相关性。研究结果显示，mRNA三级结构R_g与蛋白质折叠速率呈极显著负相关(R=-0.426,P=6.01×10^-6)。将105个蛋白质按二级结构及折叠类型分类，发现在各类蛋白质中mRNA三级结构R_g值与蛋白质折叠速率的相关程度存在差异。研究表明，mRNA三级结构的回转半径对蛋白质折叠速率具有重要影响。