基于转录组测序的肥胖小鼠脂肪组织巨噬细胞差异表达基因分析及验证

摘要

目的:研究肥胖小鼠脂肪组织巨噬细胞(ATMs)基因表达谱变化，并分析验证ATMs极化相关基因变化。方法:高脂饲料喂养C57BL/6J小鼠12周建立肥胖小鼠模型，磁珠分选附睾ATMs,提取RNA,转录组测序鉴定差异表达基因并进行功能富集分析。RT-qPCR检测ATMs极化相关基因表达。结果:与正常小鼠相比，肥胖小鼠附睾ATMs明显增多。转录组测序结果表明肥胖小鼠ATMs有2 124个上调差异基因，972个下调差异基因。RT-qPCR和RNA-seq结果表明肥胖小鼠附睾ATMs M1型极化标志物诱导型一氧化氮合酶(iNOS)、肿瘤坏死因子α(TNF-α)和白细胞介素6(IL-6)表达水平均升高(P<0.05),而M2型标志物几丁质酶3样蛋白3(Chi3l3)、精氨酸酶1(Arg1)和巨噬细胞半乳糖N-酰基半乳糖胺特异性凝集素1(Mgl1)表达水平均降低(P<0.05)。结论:肥胖小鼠附睾ATMs基因表达谱发生变化，靶向调控ATMs极化有望成为肥胖治疗的新途径。

关键词

肥胖 / 脂肪组织巨噬细胞 / 转录组测序