基于网络药理学、分子对接和孟德尔随机化探讨桦褐孔菌醇抗骨肉瘤的作用机制

摘要

目的 通过运用网络药理学和孟德尔随机化，探究桦褐孔菌醇在骨肉瘤中的抗肿瘤作用机制。方法 通过Swiss Target Prediction、PharmMapper和TargetNet数据库预测桦褐孔菌醇的药物靶点，通过孟德尔随机化获得骨肉瘤的疾病靶点。通过“venn” R包筛选药物靶点与疾病靶点的交集基因并通过GeneMANIA进行功能富集分析。通过半柔性分子对接方法探究药物与靶点的结合能力。结果 网络药理学分析显示，桦褐孔菌醇与骨肉瘤存在八个共同靶点，分别为MAPK10、CASP3、PDE5A、MTAP、FABP7、BLVRB、HMGCR和MAPK8。其中，MAPK8为全血组织唯一交集靶点，其余7个均为骨骼肌组织靶点。Gene Ontology(GO)通路分析结果显示共同靶点主要与stress-activated MAPK cascade、regulation of JUN kinase activity等有关。分子对接结果显示，桦褐孔菌醇与八个靶点均有较强的结合活性(结合能均<-5.0 kcal/mol),结合能从高到低依次为PDE5A、MTAP、FABP7、BLVRB、MAPK10、HMGCR、MAPK8和CASP3。其中与PDE5A的结合能最高(-9.1 kcal/mol),表明其可能为关键作用靶点。结论 桦褐孔菌醇可能通过调控上述相关靶点及信号通路，如stress-activated MAPK cascade、regulation of JUN kinase activity等，发挥抗骨肉瘤作用，为深入探究其作用机制指明方向。

关键词

网络药理学 / 骨肉瘤 / 桦褐孔菌醇 / 孟德尔随机化 / 分子对接

基金资助

中央支持地方高校发展改革资金人才培养支持计划项目; 黑龙江省自然科学基金项目(YQ2023H024); 齐齐哈尔医学科学院自选科研基金项目(QMSI2024Z-02)