基于生物信息学分析炎症性肠病与肝细胞癌相关性

摘要

目的 本研究旨在通过生物信息学方法探讨肝细胞癌(HCC)与炎症性肠病(IBD)之间的基因相关性。方法 以“Hepatocellular carcinoma”和“Inflammatory bowel disease”为关键词，从GEO数据库下载基因表达矩阵。对下载的基因数据进行去重处理，并将两组靶基因进行映射以获得交集靶点。利用R软件进行GO功能和KEGG通路富集分析，使用STRING数据库构建蛋白质相互作用网络图，并通过CytoHubba插件中的MCC算法筛选出关键靶点。结果 研究中共获得HCC相关靶点2061个，IBD相关靶点2868个，两者交集靶点342个。通过R软件分析，得到了336项GO功能富集结果和20条KEGG信号通路，并筛选出10个关键靶点。结论 CCNB1、CCNA2、CDC20、BIRC5和KIF2C被确定为IBD和HCC的关键基因。此外，研究还发现E2F1、E2F3、E2F4、KLF4、KLF5、P53、YBX1、MYC、SP1、RELA和NFKB1可能调节这些关键基因。这些枢纽基因及其转录或转录后产物可能作为HCC和IBD连接机制的潜在治疗靶点。

关键词

炎症性肠病 / 肝细胞癌 / 生物信息学 / 基因富集分析