外周T细胞淋巴瘤的铁死亡作用机制及其潜在治疗中药预测

摘要

目的 基于生物信息筛选外周T细胞淋巴瘤(PTCL)铁死亡差异表达基因及其作用机制并预测潜在治疗中药。方法 利用GEO数据库GSE132550数据筛选PTCL差异基因并在线进行差异表达分析，利用FerrDb数据库铁死亡相关人类基因，同时筛选共同基因。利用STRING数据库对共同基因进行PPI分析，获取核心基因。利用DAVID数据库对共同基因进行富集分析，利用CoremineMedical数据库对共同基因进行中药预测，使用Autodock Vina软件对关键活性成分进行分子对接验证，并将结果进行可视化呈现。结果 分析得到42个PTCL铁死亡差异表达基因，根据筛选条件获得NOX4、GPX2、DUOX1等5个核心基因。富集分析结果提示调节JAK-STAT信号通路、NOD样受体信号通路、Toll样受体信号通路等通路为PTCL铁死亡关键通路。中药预测结果显示主要中药18味，主要为寒性，以柴胡、丹参、鹅不食草等5种中药较为关键，核心活性成分为异鼠李糖、山奈酚、槲皮素。结论 柴胡、丹参、鹅不食草等中药所含异鼠李糖、山奈酚、槲皮素等成分通过调控NOX4、GPX2、DUOX1等靶点来调控铁死亡治疗PTCL。

关键词

外周T细胞淋巴瘤 / 铁死亡 / 生物信息 / 差异基因 / 中草药