基于网络药理学与分子对接探讨黄芪甲苷通过调控铁死亡促进血管形成的机制

摘要

目的 网络药理学与分子对接探讨黄芪甲苷通过调控铁死亡促进血管生成的机制。方法 通过SwissTarget Prediction和GeneCards数据库筛选黄芪甲苷的相关靶点，通过GeneCards数据库筛选血管生成的相关靶点，将交集基因Venny分析，获得铁死亡在黄芪甲苷促进血管生成中的潜在靶点。运用STRING数据库构建交集基因的PPI网络，数据导入Cytoscape 3.10.1软件构建PPI网络，根据degree对潜在靶点排序，采用AutoDock vina软件进行分子对接，通过Pymol软件进行受体和配体可视化处理。借助DAVID数据库及微生信对靶点基因进行GO和KEGG富集分析。结果 获得铁死亡在黄芪甲苷促进血管生成中的8个关键靶点，包括TGFB、IL1B、H19、IL6、PPARG、HIF1A、GSK3B、PVT1、MIR214、NOX4、STAT,分子对接表明黄芪甲苷与潜在靶点的结合性能良好，富集分析提示上述靶点参与多条血管生成相关的信号通路。结论 黄芪甲苷可以通过与多个靶点结合调控铁死亡，发挥促进血管生成的作用。

关键词

黄芪甲苷 / 铁死亡 / 血管形成 / 网络药理学 / 分子对接