77份山西黍稷DNA二维码身份证的构建

曹越, 曹晓宁, 陈凌, Santra Dipak K, 乔治军, 王瑞云

山西农业科学 ›› 2024, Vol. 52 ›› Issue (02) : 8 -15.

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77份山西黍稷DNA二维码身份证的构建

    曹越, 曹晓宁, 陈凌, Santra Dipak K, 乔治军, 王瑞云
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摘要

为了更好地管理黍稷资源,分辨其身份以及追溯来源,创建一个高效可行的种质资源鉴定系统十分必要。以山西省内各地77份黍稷资源为材料,用上海生工生物股份有限公司合成上游5'端加FAM (blue)荧光基团标记对77份黍稷资源进行PCR及毛细管电泳。结果发现,仅用5个标记组合(RYW3、RYW6、RYW20、RYW37和RYW40)可区分全部材料。其中,组合RYW6+RYW37可区分60份;组合RYW6+RYW20+RYW37可区分69份;组合RYW6+RYW20+RYW37+RYW40可区分73份;组合RYW3+RYW6+RYW20+RYW37+RYW40可区分全部77份。77份材料在8个位点共检出79个等位变异,每个位点检出平均为9.875个,检测到的有效等位变异(Ne)为2.675 9,Shannon多样性指数(I)为0.991 6,Nei's基因多样性指数(Nei)为0.426 0,多样性信息含量(PIC)为0.553 3。在此基础上,利用ID analysis 4.0在线条形码生成器将对应字符串生成可扫描的条形码DNA分子身份证;利用二维码在线技术将材料基本信息转化成可扫描的二维码DNA分子身份证。

关键词

SSR / 黍稷 / 二维码 / 山西

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77份山西黍稷DNA二维码身份证的构建[J]. 山西农业科学, 2024, 52(02): 8-15 DOI:

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