基于基因组结构方程模型的阿尔茨海默病和心血管疾病的共享遗传结构研究

摘要

目的 利用基因组结构方程模型(genome structural equation modeling,GSEM )研究阿尔茨海默病(Alzheimer's disease,AD)和8种心血管疾病(cardiovascular disease,CVD)之间的共享遗传结构。方法 本研究基于大型联盟和全基因组关联研究中的AD和CVD数据，运用连锁不平衡分数回归评估疾病之间的遗传相关性;引入GSEM，在奇数染色体进行探索性因子分析、偶数染色体进行验证性因子分析来交叉验证，并结合路径分析建立三因子模型、共因子模型和双因素模型，从而揭示各疾病之间复杂的遗传关系。此外，还将奇偶染色体互换位置进行了相互验证。结果 所选取的9种疾病可以被3个独立的因子所构成的三因子模型所解释;共因子模型可解释一个共因子与各疾病之间的关系;扩展的双因素模型(三因子模型和共因子模型的结合)在拟合研究数据时表现最佳。结论 GSEM可用于探索AD与CVD之间的共享遗传结构以发现两者的相互作用，为理解复杂疾病之间的遗传关系奠定了方法学基础。

关键词

基因组结构方程模型 / 因子分析 / 阿尔茨海默病 / 心血管疾病