基于分子对接技术的天然产物源植物免疫激活剂的筛选

冯文博; 刘同; 金碟; 夏雨辰; 何湘瑶; 胡晴; 司娟; 陈玉欣

湖北工业大学学报 ›› 2026, Vol. 41 ›› Issue (2) : 85 -92.

冯文博, 刘同, 金碟, 夏雨辰, 何湘瑶, 胡晴, 司娟, 陈玉欣

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摘要

采用分子对接技术,从大宗中药材中筛选具有植物免疫激活活性的天然产物。从蛋白质数据库(PDB)中获取Toll/interleukin-1 receptor-like protein(TIR)的3D结构,从中药系统药理学数据库TCMSP中获取多种大宗药材的主要化学成分,接着在PubChem数据库中获取这些化学成分作为小分子配体的2D结构,通过AutoDock Vina分子对接软件分析TIR与中药化学成分的结合能,初步筛选出潜在活性成分;随后采用带药平板法与离体叶片法进行活体验证。通过分子对接初步筛选出47种能与TIR结合的中药化学成分,且结合能较低;体外抗菌活性实验发现盐酸药根碱、防己诺林碱的体外直接抑菌率较低;离体叶片实验发现盐酸药根碱和防己诺林碱能提高植物对灰霉侵染的抵御能力。盐酸药根碱、防己诺林碱具有一定程度的免疫激活作用,可以作为潜在的植物免疫激活剂进行开发。