褶牡蛎线粒体全基因组遗传特征

摘要

基于新一代基因组测序技术，解析大连沿海石城岛海域（122°98'38''E,39°56'69''N）褶牡蛎（Alectryonella plicatula）的完整线粒体基因组，重建牡蛎属的系统发生关系，探索褶牡蛎在巨蛎属中系统发生地位。结果表明，褶牡蛎的线粒体全基因组大小为18 225 bp，包含12个蛋白质编码基因、24个tRNA基因和2个rRNA基因，atp8基因缺失，这与大多数双壳类动物一致。系统发育分析结果表明，褶牡蛎与长牡蛎（Crassostrea gigas）的亲缘关系最近，这个进化枝与福建牡蛎（C. angulata）聚为一枝，而熊本牡蛎（C. sikamea）则是包含福建牡蛎和长牡蛎以及褶牡蛎的进化枝的姐妹群。本研究首次解析了褶牡蛎的完整线粒体基因组，从线粒体全基因组分析的角度再次验证大连沿海常见的“褶牡蛎”为长牡蛎。

关键词

褶牡蛎 / 基因组 / 线粒体

基金资助

辽宁省海洋经济发展专项（202222）; 辽宁省海洋与渔业厅科研专项（201818）; 大连市科技创新基金（2021YF16SN015、2021JB11SN035）; 辽宁省农业科学院学科建设计划（2022DD269339）; 辽宁省农科院农业种质资源发掘、创制与利用专项（2021GR2905）