不同触手数目的海蜇螅状体比较转录组分析

摘要

海蜇（Rhopilema esculentum）是我国重要的海洋经济动物，具有独特的生活史，其中无性繁殖螅状体阶段持续时间最长，约占整个生活史周期的60%，是海蜇生长发育的关键阶段。本研究利用Illumina HiSeq测序技术对具有16条、20条和24条触手的螅状体进行转录组测序，共获得789.23 Mreads，拼接得到116 501条unigenes，检测到超过1.1 M SNP位点、4 858个SSR位点和2 580个差异表达标签（DEGs）。差异表达基因KEGG富集结果表明，螅状体触手数目与蛋白质、葡萄糖、丙氨酸、甘氨酸和苏氨酸等多个氨基酸代谢通路相关，且触手数目越多的螅状体代谢水平越高。显著差异表达基因分析显示，表皮生长因子（egfr）、RNA结合基序蛋白、rbm46基因、蛋白磷酸酶2A(pp2a)、T-box基因、新生多态相关复合体α(naca)和hox基因随着触手数目的增加上调表达；细胞色素P450和超氧化物歧化酶1(sod1)基因下调表达。本实验结果可为螅状体触手数目分化个体的生长发育及差异形成相关基因的挖掘与功能研究提供基础信息，也为海蜇无性繁殖阶段人工选育提供重要参考。

关键词

海蜇 / 螅状体 / 触手 / 转录组 / 差异表达基因