海水养殖中华鲟黏液、肠道和环境微生物多样性研究

摘要

中华鲟（Acipenser sinensis）是我国长江流域特有的珍稀物种，其在海水中的生活时间占生活史的90%，因此海水环境对其生长发育的影响尤为重要。本研究运用16S r RNA高通量测序技术，探究海水养殖模式对中华鲟体表黏液、肠道内容物及其养殖水体中微生物群落结构的影响。结果显示：黏液微生物多样性最高，养殖水体次之，肠道内容物最低。黏液、肠道内容物、养殖水体的微生物菌群结构存在显著差异。在门水平，黏液和肠道内容物均以变形菌门、厚壁菌门和放线菌门为主，养殖水体中则以放线菌门、变形菌门和拟杆菌门为主。在属水平，海水养殖中华鲟亚成体肠道内容物中优势菌属为副梭菌属（Paraclostridium）、发光杆菌属（Photobacterium）、弧菌属（Vibrio），黏液中优势菌群为葡萄球菌属（Staphylococcus）、考克氏菌属（Kocuria），养殖水体中优势菌属为Candidatus Aquiluna、NS3a＿marine＿group。结合热图可视化结果，共检测到11个潜在病原菌属，Bug Base功能预测显示肠道内容物中潜在致病菌占比显著高于黏液和水体，革兰氏染色类型和氧气需求特征亦表现出显著差异。研究揭示了中华鲟不同部位及其养殖环境微生物群落的组成特征和功能潜力，表明肠道可能是潜在致病菌的主要富集区域，黏液和水体的菌群结构亦与宿主健康密切相关。本研究结果可为海水养殖条件下中华鲟微生态研究、病害防控及健康养殖模式优化提供理论支持。

关键词

中华鲟 / 黏液 / 肠道内容物 / 养殖水体 / 微生物多样性 / 高通量测序