跨膜蛋白201在肝细胞癌中的表达及其预后意义与作用机制

摘要

背景与目的：研究发现跨膜蛋白（TMEM）家族基因与肿瘤关系密切，TMEM201是TMEM家族的一员，其在肝细胞癌（HCC）中的表达与作用目前尚不清楚。因此，本研究通过生物信息学方法分析TMEM201在HCC中的表达与作用，并预测其在HCC中可能作用的通路，进而探讨机制。方法：在TIMER中分析TMEM201在泛癌中的表达。下载TCGA与GEO数据库中HCC患者数据，并收集106例HCC患者的手术标本与临床信息，分析TMEM201在肝癌组织与癌旁组织中的表达情况，并绘制生存曲线，分析TMEM201表达与HCC患者的预后关系。用单因素与多因素Cox分析判断HCC相关危险因素。根据TCGA与临床数据，分析TMEM201的表达与HCC患者临床病理特征的关系。应用String和GeneMANIA数据库绘制与TMEM201及其相关基因的网络图谱。通过TCGA数据库分析TMEM201与免疫细胞的关系。通过LinkedOmics数据库分析与TMEM201相关的共表达基因，并对共表达基因进行GO功能分析与KEGG通路预测。结果：泛癌分析结果显示，TMEM201在绝大部分肿瘤中呈高表达。多数据库及临床HCC标本免疫组化分析显示，TMEM201在HCC组织中的表达明显高于癌旁组织（均P<0.05），且TMEM201高表达患者生存时间明显短于低表达患者。单因素与多因素Cox风险回归提示TMEM201的表达是HCC患者总体生存率的独立危险因素。蛋白质互作网络、GeneMANIA数据库分析显示，TMEM201与SUN1、SUN2、LMNB1、EMD等基因存在明显相互作用。免疫浸润分析结果显示，TMEM201表达与树突状细胞、细胞毒性细胞、Th2细胞等明显有关。此外，功能富集分析显示，TMEM201与共表达基因参与了许多HCC的生物学过程、细胞组成、分子功能和作用通路。通路结果及相关性热图提示TMEM201与细胞周期高度相关。结论：TMEM201在HCC组织中高表达，是影响HCC患者预后的独立危险因素，TMEM201在HCC中的作用机制可能与免疫浸润的调节、细胞周期的调控有关。

关键词

癌,肝细胞 / 跨膜蛋白201 / 预后 / 计算生物学